رسالت اتحادیه دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالی غیردولتی- غیرانتفاعی

هماهنگی در اجرای برنامه‌های توسعه علمی بویژه کاهش تصدی‌گری دولت و توسعه مشارکت مردمی در بخش آموزش عالی
زمینه‌سازی در جهت ارتقای کیفیت علمی و پژوهشی مؤسسات آموزش عالی غیرانتفاعی - غیر دولتی
فعالیت در جهت تأمین نیاز های مرتبط با توسعه پایدار و ضابطه مند بخش آموزش عالی غیرانتفاعی - غیر دولتی
"انسجام بخشی" و" ایجاد هماهنگی" در فعالیت‌های مربوط به بخش‌های دولتی و غیردولتی
معرفی استانداردهای مؤسسات و کمک به نظارت برفعالیت‌های آموزشی و پژوهشی آنها
توسعه مراودات علمی – پژوهشی و فعالیت‌های مشترک با مراکز علمی داخل و خارج از کشور با رعایت مقررات و ضوابط
تلاش در جهت توانمند سازی نظام مدیریت عمومی و علمی مؤسسات آموزش عالی غیرانتفاعی - غیر دولتی
مشارکت در نظام تصمیم‌سازی بخش آموزش عالی کشور
انتشار کتب و نشریات علمی.